Año 2015. Tokio-3 se encuentra bajo el ataque de los Angeles, seres extraordinarios que poseen diferentes habilidades especiales. Shinji Ikari es escogido como piloto de una de las Armas de Combate Humanoide de Propósito General Evangelion, que son el único método para contrarrestar a estos Ángeles. La batalla que determinará el destino de la humanidad ha dado comienzo. Pero ¿qué son exactamente los Ángeles? ¿Cuál será el destino de los jóvenes pilotos y de la humanidad?